输入:[.bam)]

开始

输入:[(chip, chip.bed±450)]

取bam的Offtarget区间

sort

index

采样reads

3M(正反链,实际只有1.5M左右)

reads质控

insertsize

reads质控

CNVkit

T-MAD

reads质控

short_long-ratio

min-max归一化

PCA降维

多层感知机mlp

输出: pipeline+训练好的mlp模型

结束

健康人建基线

insertsize+fragementation

insertsize+fragementation

2020-01-13 18:00:50 0 7
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