开始

输入:[(chip.bed, flk50_chip.bed±400)]

取bam的Offtarget区间

sort

index

采样reads

10M(正反链,实际只有5M左右)

reads质控

insertsize

reads质控

CNVkit

T-MAD

reads质控

short_long-ratio

健康人建基线

min-max归一化

PCA降维

多层感知机mlp

输出: pipeline+训练好的mlp模型

结束

min-max归一化

PCA降维

多层感知机mlp

输出: pipeline+训练好的mlp模型

输出: 多模型投票

输入:[.bam)]

SNP

等级规则

随机森林RF

输出: pipeline+训练好的RF模型

insertsize

insertsize

2019-12-16 14:46:43 0 27
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